撰写史书本来应该是一件严谨的事情，但是对于史学大师司马迁而言，他却在《史记》里面犯了一个严重的错误，以致于后人因为他的这个错误对千古一帝秦始皇的身世产生怀疑。因为司马迁的失误，导致了从西汉开始，大部分学者都在怀疑秦始皇的出身。
在《史记·秦始皇本纪》里面记载着：“秦始皇帝者，秦庄襄王子也。 庄襄王为秦质子于赵，见吕不韦姬，悦而取之，生始皇。 以秦昭（襄）王四十八年正月生于邯郸”。
但是在《史记·吕不韦列传》当中却记载：“吕不韦取邯郸诸姬绝好善舞者与居，知有身。子楚从（吕）不韦饮，见而说（悦）之，因起为寿，请之。吕不韦怒，念业已破家为子楚，欲以钓奇，乃遂献其姬。姬自匿有身，至大期时，生子政。子楚遂立姬为夫人”。
正是司马迁的这两张截然不同的说法，才导致了后人也不敢确定秦始皇到底是秦庄襄王的儿子还是吕不韦的儿子。
其实秦始皇到底是谁的儿子这点，根本用不着推敲。在古代皇族里面，对于血统有着严格的核查。根本没办法像《吕不韦列传》里面说的那样，吕不韦把带有身孕的赵姬献给子楚。再者从孩子父亲子楚的态度也可见端倪。子楚后来作为秦国的储君，派人去赵国接回了赵姬、嬴政母子二人，刚刚接回国不久后，子楚便以赵姬为太子正妻, 以嬴政为“王太孙”继承人。如果子楚对于嬴政身份有所怀疑的话，那么他完成可以立次子成蟜为太子。
最初吕不韦不过是个商人，因为做商人已经满足不了他了，所以当他遇到了具有秦国王室血统的子楚之后，便认为“奇货可居”，变卖家财全力帮助子楚回国争位。这场赌注的成功点就在于血统，对吕不韦而言维护子楚一脉的血统的纯正才是自己的首要任务，对于赵姬之子，吕不韦避嫌都来不及，还敢去给子楚戴绿帽。要是他真的给子楚戴绿帽，子楚还不跟他反目为仇，自己的这个“投资”岂不是打水漂。
在一些勇敢的后世史学家的推论当中，秦始皇绝对是货真价实的“老秦人”。如明代史学家汤聘尹在他的在《史稗》一书中对此公开提出挑战，认为秦始皇是私生子的记载是“战国好事者为之”的胡说八道，根本没有可靠的依据。
同为明朝的著名学者王世贞也认为秦始皇绝非吕不韦之子，他在《读书后记》中提出了两点见解：一、这是大阴谋家吕不韦故意编造的故事，其目的在于抬高自己的身份和地位，并暗示秦始皇能让其长久富贵。一旦遭遇不测，还可陷他这位“皇子”于不义不孝不仁不礼的难堪境地。二、这种说法很可能出自吕氏门客和被秦所灭的六国贵族遗老遗少之口。他们诬骂秦始皇是私生子，用来发泄难言的私愤，并使天下的人知道秦国在事实上比六国先亡。
现代学者郭若沫先生同样对司马迁关于嬴政是吕不韦儿子的说法提出质疑，质疑的主要根据就是在在同一篇《吕不韦列传》当中，前文提及赵姬是邯郸歌舞姬，到了后文又变成了“子楚夫人，赵豪家女也”。前后自相矛盾的说法，本身就证明了这篇列传的不严谨。
其次是文中还说“姬自匿有身，至大期时生子政”，这里的“大期”，到底多长时间？根据东晋徐广说是大过十二个月，三国蜀人谯周说是大过十个月。这里不管是十月还是十二月，都符合或超过人类正常的生育时间。假设秦始皇真的是在赵姬怀了吕不韦之子后，才献给子楚的，那么生育时间只能是低于十个月而非刚好十个月或者超过十个月。由此推算嬴政应是子楚的儿子，而非吕不韦的血脉。
那么自西汉以后，为何绝大部分学者都认为嬴政是吕不韦的私生子呢？除了像前文提到的明代学者王世贞所说的那样：第一吕不韦在成为“仲父”，秦国的相国后，大权在握的情况下，为了保全自己，四处散布谣言，以求自保；第二那些失势的门客跟六国贵族泄私愤，四处谣传。
还有就是到了西汉时期，刘邦为了证明其得国之正，也有意让这个谣言广泛传播。而之后的吕后掌权，吕氏一族为了提升吕氏的门第，对秦始皇是吕不韦之子的说法更是极力推崇。当然最重要的是秦始皇得罪了太多儒家学者，后世儒家学者为了报复他，一致认可了秦始皇是吕不韦之子的说法。
秦始皇的父亲，是秦庄襄王，公元前247年5月，秦庄襄王去世，享年三十五岁，十三岁的嬴政继位。由于年少，遭到周围人的欺负。吕不韦是个很有计谋之人，就做了秦始皇的仲父。辅佐秦始王嬴政，嬴政从小在逆境中长大，能隐忍负重。胸怀大志，后来灭了六国。统一了秦国。后来立他的父亲秦庄襄王为太上皇。所以秦始皇嬴政不是秦朝的开国皇帝。是他父亲秦庒襄王太上皇是开国皇帝。
